Институт является государственным научным учреждением в системе Россельхозакадемии и в своей деятельности руководствуется Федеральным законом «О науке и научно-технической политике» № 127-фз от 23 августа 1996 года (с изменениями от 1998 и 2000 гг.), законодательными и нормативными актами, действующими на территории Российской Федерации, постановлениями, приказами и распоряжениями Россельхозакадемии, Уставом Россельхозакадемии и Уставом института.

В центре внимания научной деятельности института были и остаются фундаментальные и прикладные проблемы в области ветеринарной микробиологии, вирусологии, эпизоотологии, биотехнологии.

Научная деятельность института осуществляется в рамках федеральных и отраслевых целевых научно-технических программ, грантов, международных проектов и прямых договоров в соответствии с нижеследующими основными направлениями.

Основные направления научной деятельности ГНУ ВНИИВВиМ Россельхозакадемии:

— фундаментальные, поисковые и приоритетные прикладные исследования инфекционных болезней млекопитающих и рыб (эпизоотология, ветеринария, вирусология, микробиология, иммунология, биотехнология, диагностика) и реализация результатов НИР в народное хозяйство страны;
— создание средств и методов защиты сельскохозяйственных, домашних, промысловых и диких животных от особо опасных, экзотических и малоизученных инфекционных болезней;
— разработка предложений и рекомендаций по повышению устойчивости функционирования агропромышленного комплекса РФ;
— прецизионные диагностические исследования на особо опасные инфекции животных;
— экспериментальное и промышленное производство отдельных разработанных в институте биопрепаратов;
— подготовка научных кадров по профилю института.

По этим перечисленным направлениям научной деятельности институт решает следующие задачи:

— разрабатывает и совершенствует средства и методы лабораторной диагностики особо опасных и экзотических инфекционных болезней и индикации возбудителей;
— проводит диагностические исследования при подозрении на особо опасные и экзотические инфекционные болезни животных;
— разрабатывает средства и методы специфической и неспецифической профилактики и химиотерапии вирусных и бактериальных болезней животных и рыб;
— изучает биологию, биохимию и генетику возбудителей вирусных и бактериальных болезней; механизмы взаимодействия вируса с клетками;
— разрабатывает методы получения, хранения и производства культур клеток и питательных сред; комплектует банки штаммов культур клеток;
— комплектует и поддерживает коллекцию штаммов и изолятов возбудителей инфекционных болезней и антисывороток к ним; изыскивает оптимальные условия поддержания, селекции и длительного консервирования имеющихся в музее микроорганизмов;
— изучает патогенез, иммуногенез и цитоморфологию при вирусных и бактериальных болезнях животных;
изучает эпизоотологию инфекционных болезней животных и разрабатывает меры борьбы с ними, совершенствует методы мониторинга инфекционных болезней и прогнозирует их появление и распространение на территории страны;
— разрабатывает средства и методы массовой, в частности, аэрозольной и пероральной иммунизации животных;
— совершенствует и разрабатывает технологию производства вакцинных и диагностических препаратов;
координирует совместные научные исследования в учреждениях Россельхозакадемии, а также научных учреждениях и организациях других министерств и ведомств;
— обеспечивает защиту научного и государственного приоритета по выполненным НИОКР и работ по изобретательству, своевременному рассмотрению, патентованию и внедрению изобретений и рационализаторских предложений;
— ведет образовательную деятельность по подготовке научных кадров высшей квалификации (аспирантура, докторантура, соискательство).

Впервые в России институтом разработаны современные средства и методы лабораторной диагностики африканской чумы свиней, классической чумы свиней, чумы крупного рогатого скота, контагиозной плевропневмонии крупного рогатого скота, блютанга, гриппа птиц, ньюкаслской болезни, оспы овец и коз, бешенства, сибирской язвы, эпизоотической геморрагической болезни оленей, геморрагической болезни кроликов, пограничной болезни овец, болезни Найроби, болезни Ибараки, болезни Акабане, Шмаленберги других особо опасных, зооантропонозных и экзотических инфекционных болезней животных. Предложены схемы и методы индикации (обнаружения) возбудителей этих болезней в объектах ветеринарного надзора и окружающей среде на основе достижений молекулярной биологии и генной инженерии.

Институт является исполнителем и координатором научных исследований по 2 этапам НИР Межведомственного Плана фундаментальных и приоритетных прикладных исследований по научному обеспечению АПК РФ на 2011-2015гг. по проблеме VIII «Разработка новых методов, средств, техники и технологий диагностики, лечения и профилактики особо опасных и наиболее распространенных болезней животных на основе изучения молекулярно-биологических и генетических механизмов их развития с целью получения продукции животноводства высокого санитарного качества».

Научные исследования, выполняемые на договорной основе в 2010-2012 гг. проводились в рамках 2-х грантов РФФИ, президентского гранта для молодых ученых, 2-х Госконтрактов с Минсельхозом России, Госконтракта с Минобрнауки России по целевой программе ЕврАзЭС «Инновационные биотехнологии, контракта с ФАО, контракта с Европейским союзом.

По результатам проведенных исследований в 2006-2012 гг. разработано 12 вакцин, 18 диагностикумов, получено 2 производственных штамма, оформлено 83 комплекта нормативной документации, получено 40 патентов, опубликовано 12 книг, 465 статей, 6 сборников трудов, 60 авторефератов диссертаций. Внедрено более 30 научных разработок института. Разработаны модели прогнозов опасности заноса и распространения особо опасных болезней животных, подготовлены методические положения по ведению эпизоотического мониторинга экзотических, особо опасных и малоизученных болезней животных; составлены каталоги неблагополучных территорий в мире по африканской и классической чуме свиней, блютангу, гриппу птиц, ньюкаслской болезни, аденоматозу овец, диагностические тест-системы на основе анализа генома и иммуноферментного анализа, созданы банки и коллекции штаммов микроорганизмов и культур клеток, получены гибридомы и моноклональные антитела.

В 2011-2012 гг. институт участвует в выполнении Государственного Задания по оказанию услуг и выполнению работ и Программы фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2008-2012 годы.

В рамках грантов РФФИ выполняется 2 темы: «Разработка и применение новых технологий при конструировании диагностических и вакцинных препаратов против лихорадки долины Рифт», «Рекомбинантные белки вируса АЧС для изучения основ его иммуногенности и патогенности».

Активно проводится сотрудничество с зарубежными научно-исследовательскими учреждениями Испании, Германии, США, Польши, Нидерландов, Китая, Монголии, Беларуси, Таджикистана, Украины и др. в областях, представляющих взаимный интерес, предусматривающее организацию визитов научных специалистов ВНИИВВиМ, прием зарубежных ученых, обмен научной информацией и продукцией, участие в международных научных конференциях.

В соответствии с приказам Россельхозакадемии в институте активно работает ученый совет. Состав ученого совета переутвержден постановлением Президиума Россельхозакадемии 16 марта 2006 г. (протокол № 3) и включает 24 ведущих специалиста по профильным направлениям научной и производственной деятельности института.

Председатель ученого совета: директор института, доктор ветеринарных наук, профессор КОЛБАСОВ Денис Владимирович.

Заместитель председателя ученого совета: заместитель директора по производству и качеству, кандидат ветеринарных наук, старший научный сотрудник ЛУНИЦИН Андрей Владимирович.

Секретарь ученого совета: кандидат биологических наук БАЛАШОВА Елена Алексеевна.

На заседаниях ученого совета заслушиваются научные доклады по актуальным проблемам ветеринарной науки, определяются приоритетные направления научной деятельности, рассматриваются вопросы перспективного планирования, обсуждаются наиболее важные результаты научно-исследовательской деятельности в целом по института и по отдельным лабораториям и отделам; рассматриваются методические разработки, рекомендации, инструкции, наставления, заявки на изобретения, обсуждается структура и штатное расписание института, утверждаются темы кандидатских и докторских диссертаций и др.